Счётная палата Маловишерского муниципального района является постоянно действующим органом внешнего муниципального финансового контроля, образуется Думой Маловишерского муниципального района и в своей деятельности ей подотчетна. Счётная палата входит в структуру органов местного самоуправления Маловишерского муниципального района и обладает правами юридического лица.
Счётная палата состоит из председателя, аудитора и аппарата Счётной палаты .
Председатель и аудитор назначаются на должность Думой Маловишерского муниципального района. Срок их полномочий составляет пять лет.